From c30b7d3c2d116a0fa15caab7177554a884a9c1b9 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: ndwarshuis Date: Tue, 27 Jul 2021 13:48:26 -0400 Subject: [PATCH] ADD grex figure --- figures/grex_luminex.svg | 13783 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++ figures/grex_results.svg | 1946 ++++++ tex/thesis.tex | 39 +- 3 files changed, 15765 insertions(+), 3 deletions(-) create mode 100644 figures/grex_luminex.svg create mode 100644 figures/grex_results.svg diff --git a/figures/grex_luminex.svg b/figures/grex_luminex.svg new file mode 100644 index 0000000..8ecf9f7 --- /dev/null +++ b/figures/grex_luminex.svg @@ -0,0 +1,13783 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 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+ + IL12p70 + + + + + + + + + + + + + + + + IL13 + + + + + + + + + + + + + + + + IL15 + + + + + + + + + + + + + + + + IL16 + + + + + + + + + + + + + + + + APRIL + + + + + + + + + + + + + + + + BAFF + + + + + + + + + + + + + + + + GM_CSF + + + + + + + + + + + + + + + + IFN_alpha + + + + + + + + + + + + + + + + IFN_gamma + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 10 + + + + + + + + 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+ + + + 0 + 5 + 10 + 15 + 20 + 25 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0 + 1000 + 2000 + 3000 + 4000 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0e+00 + 1e+06 + 2e+06 + 3e+06 + 4e+06 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 100 + 200 + 300 + 400 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0 + 25 + 50 + 75 + 100 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0 + 100 + 200 + 300 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0 + 1000 + 2000 + 3000 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0 + 5000 + 10000 + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0 + 5000 + 10000 + 15000 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Time (days) + + + + Cytokine Conc. (pg/ml) + + + + + + + + + + + + + + + + Method + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + bead + + + + + + + DMS + + + + + + + + + + + + + + + + + diff --git a/figures/grex_results.svg b/figures/grex_results.svg new file mode 100644 index 0000000..3aef13d --- /dev/null +++ b/figures/grex_results.svg @@ -0,0 +1,1946 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + image/svg+xml + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0 + 25 + 50 + 75 + 100 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0 + 5 + 10 + 15 + + + + + + + + Time (days) + + + + Viability + + + + + + + + + + + + + + + + Method + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + bead + + + + + + + DMS + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 3 + 6 + 9 + 12 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0 + 5 + 10 + 15 + + + + + + + + Time (days) + + + + Fold change + + + + + + + + + + + + + + + + Method + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + bead + + + + + + + DMS + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0.0% + 10.0% + 20.0% + 30.0% + 40.0% + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + CD4+ + CD4+CCR7+CD62L+ + CD8+CCR7+CD62L+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + method + + + + + + + + + + + + + + + + + + + bead + + + + + + + DMS + + + + + + + + + + + + + + + + a. + b. + c. + + diff --git a/tex/thesis.tex b/tex/thesis.tex index b478e89..49a8432 100644 --- a/tex/thesis.tex +++ b/tex/thesis.tex @@ -1300,9 +1300,42 @@ showing that migration was likely independent of \gls{car} transduction. \subsection{DMSs efficiently expand T cells in Grex bioreactors} -% FIGURE grex -% FIGURE luminex -% FIGURE grex + car +% RESULT Grex bioreactor and luminex + +% TODO this figure has wonky proportions +% TODO add stats for the phenotype stuff +% TODO the phenotype figure should say "percent of CD3+" +\begin{figure*}[ht!] + \begingroup + + \includegraphics{../figures/grex_results.png} + \phantomsubcaption\label{fig:grex_results_fc} + \phantomsubcaption\label{fig:grex_results_viability} + \phantomsubcaption\label{fig:grex_phenotype} + + \endgroup + \caption[Grex bioreactor results] + {\glspl{dms} expand T cells robustly in Grex bioreactors. + \subcap{fig:grex_results_fc}{Fold change of T cells over time.} + \subcap{fig:grex_results_viability}{Viability of T cells over time.} + \subcap{fig:grex_results_viability}{Phenotype of T cells after \SI{14}{\day} + of expansion.} + } + \label{fig:grex_results} +\end{figure*} + +\begin{figure*}[ht!] + \begingroup + + \includegraphics{../figures/grex_luminex.png} + + \endgroup + \caption[Grex luminex results] + {\gls{dms} lead to higher cytokine production in Grex bioreactors.} + \label{fig:grex_luminex} +\end{figure*} + +% FIGURE grex + car (maybe, IDK if I actually have this data) \subsection{DMSs do not leave antibodies attached to cell product}