diff --git a/figures/mouse_dosing_input_cells.svg b/figures/mouse_dosing_input_cells.svg new file mode 100644 index 0000000..b5cb129 --- /dev/null +++ b/figures/mouse_dosing_input_cells.svg @@ -0,0 +1,1490 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + image/svg+xml + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0% + 25% + 50% + 75% + 100% + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Beads + DMS + + + + + + + + + + CCR7+CD62L+ Fraction (of CD3+) + + + + + + + + + + + + + + + + CD45RA + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0% + 25% + 50% + 75% + 100% + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Beads + DMS + + + + + + + + + + CD4+ Fraction (of CD3+) + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0e+00 + 1e+07 + 2e+07 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0 + 5 + 10 + + + + + + + + Time (days) + + + + Total cells + + + + + + + + + + + + + + + + Method + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Bead + + + + + + + DMS + + + + + + + + + + + + + + + + a. + b. + c. + + diff --git a/figures/mouse_dosing_ivis.svg b/figures/mouse_dosing_ivis.svg new file mode 100644 index 0000000..750d84b --- /dev/null +++ b/figures/mouse_dosing_ivis.svg @@ -0,0 +1,5371 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 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elapsed + + + Percent survival + + Untreated + + + Bead MedDose + + + + Bead LoDose + + + + Bead HiDose + + + + DMS HiDose + + + + DMS MedDose + + + + DMS LoDose + + + + + + ** + Bead + Untreated + DMS + + + + + ** + + + + + ** + + + + + * + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + a. + b. + c. + d. + Survial + Survival (Bead High or Med vs DMS Lo) + + diff --git a/figures/mouse_dosing_overview.svg b/figures/mouse_dosing_overview.svg new file mode 100644 index 0000000..2f94ff3 --- /dev/null +++ b/figures/mouse_dosing_overview.svg @@ -0,0 +1,534 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + image/svg+xml + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Bioluminescence imaging at 5-7 dayintervals and survival monitoring + Nalm-6-ffluctumor cellinjection (1e6, IV) + Bioluminescenceimaging + CAR T cell injection(varying doses, IV) + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Activate(bead or DMS) + Transduce + Harvest/QC + D1 + + T cell expansion + NSG Mice + Test T cells atvarying doses + + diff --git a/figures/mouse_timecourse_input_cells.svg b/figures/mouse_timecourse_input_cells.svg new file mode 100644 index 0000000..cee3255 --- /dev/null +++ b/figures/mouse_timecourse_input_cells.svg @@ -0,0 +1,2084 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + image/svg+xml + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0.0% + 20.0% + 40.0% + 60.0% + 80.0% + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Day 6 + Day 10 + Day 14 + + + + + + + + + + CCR7+CD62L+ Fraction (of CD3+) + + + + + + + + + + + + + + + + Method + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Bead + + + + + + + DMS + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0.0% + 5.0% + 10.0% + 15.0% + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Day 6 + Day 10 + Day 14 + + + + + + + + + + CAR+ Fraction + + + + + + + + + + + + + + + + Method + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Bead + + + + + + + DMS + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0.00% + 2.00% + 4.00% + 6.00% + 8.00% + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Day 6 + Day 10 + Day 14 + + + + + + + + + + CAR+CD4+ % (of CD3+) + + + + + + + + + + + + + + + + Method + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Bead + + + + + + + DMS + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0.0e+00 + 5.0e+06 + 1.0e+07 + 1.5e+07 + 2.0e+07 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 0 + 5 + 10 + + + + + + + + Time (days) + + + + Total cells + + + + + + + + + + + + + + + + Method + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Bead + + + + + + + DMS + + + + + + + + + + + + + + + + a. + c. + b. + d. + + diff --git a/figures/mouse_timecourse_ivis.svg b/figures/mouse_timecourse_ivis.svg new file mode 100644 index 0000000..c3e741b --- /dev/null +++ b/figures/mouse_timecourse_ivis.svg @@ -0,0 +1,3443 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + image/svg+xml + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + D6-Bead + D6-DMS + D10-Bead + D10-DMS + D14-Bead + D14-DMS + Saline + D6 + D14 + D21 + D28 + D35 + D42 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 5 + + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 5 + 5 + 5 + 5 + 4 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 5 + 4 + 5 + 5 + 5 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 5 + 5 + 5 + 5 + 5 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 5 + 5 + 5 + 5 + 4 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 5 + 5 + 5 + 5 + 5 + 2 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 4 + 4 + 4 + 4 + 4 + 2 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + d10_dms + + + + + + + + + + + + + + + + d14_bead + + + + + + + + + + + + + + + + d14_dms + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + saline + + + + + + + + + + + + + + + + d6_bead + + + + + + + + + + + + + + + + d6_dms + + + + + + + + + + + + + + + + d10_bead + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 10 + 20 + 30 + 40 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 10 + 20 + 30 + 40 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 10 + 20 + 30 + 40 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 10 + 20 + 30 + 40 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + 1e+05 + 1e+07 + 1e+09 + + + + + + + + + + + + + + + + + + 1e+05 + 1e+07 + 1e+09 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Time since tumor injection (days) + + + + Total Flux (photons/s) + + + + + + + + + + + + + + + + a. + b. + + diff --git a/figures/mouse_timecourse_overview.svg b/figures/mouse_timecourse_overview.svg new file mode 100644 index 0000000..024a528 --- /dev/null +++ b/figures/mouse_timecourse_overview.svg @@ -0,0 +1,599 @@ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + image/svg+xml + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Bioluminescence imaging at 5-7 dayintervals and survival monitoring + Nalm-6-ffluctumor cellinjection (1e6, IV) + Bioluminescenceimaging + CAR T cell injection + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + Activate(bead or DMS) + Transduce + Harvest/QC + Harvest/QC + Harvest/QC + D1 + + D6 + + D10 + + + + T cell expansion + NSG Mice + + Test T cells fromdifferent timepoints + + diff --git a/tables/mouse_dose_car.tex b/tables/mouse_dose_car.tex new file mode 100644 index 0000000..64c6e6f --- /dev/null +++ b/tables/mouse_dose_car.tex @@ -0,0 +1,10 @@ +\begin{tabular}{lcc} +\\[-1.8ex]\hline +\hline \\[-1.8ex] +\\[-1.8ex] & Dose & 1e6 T cells/mouse & 1e6 CAR T cells/mouse 1e6 (DMS) & CAR T cells/mouse (Bead) \\ +\hline \\[-1.8ex] +High & 1.25 & 0.855 & 0.315 \\ +Medium & 0.8325 & 0.570 & 0.210 \\ +Low & 3.313 & 0.214 & 0.079 \\ +\hline \\[-1.8ex] +\end{tabular} \ No newline at end of file diff --git a/tex/thesis.tex b/tex/thesis.tex index 504454b..89d007d 100644 --- a/tex/thesis.tex +++ b/tex/thesis.tex @@ -1599,6 +1599,23 @@ analyzed using GraphPad Prism using the Mantel-Cox test to assess significance between survival groups. \section{results} + +\subsection{DMS-expanded T cells show greater anti-tumor activity \invivo{} + compared to beads} + +% figure showing the experimental model and dosing strategy +% table for % CAR+ T cells injected into the mice +% figure for the mem and CAR+ percent injected into the mice +% figure showing IVIS images +% figure showing the surival curves + +\subsection{Beads and DMSs perform similarly at earlier timepoints} + +% figure showing the experimental model and dosing strategy +% figure for the mem and CAR+ percent injected into the mice +% figure showing IVIS images +% figure showing the photon plots per time + \section{discussion} \chapter{conclusions and future work}\label{conclusions}